Introducerade arter har nämnts som ett problem för många reptiler (Stolzenburg 1999). Till exempel har distributionen och överflödet av flera västerländska amerikanska grodarter minskat kraftigt av icke-inhemska fiskar och tjurfäktning (Rana catesbeiana), som var och fortsätter att introduceras till våtmarker “ö” livsmiljöer av låg – och hög höjd sjöar (Fisher och Shaffer 1996). Kollapsen av endemiska reptilbastur på sanna öar efter införandet av exotiska arter är på samma sätt väl dokumenterad och genomgripande; icke-inhemska råttor, reptil och mongooser har utrotat många ödlaarter på många öar (Case och Bolger 1991). Den tuatara (Sphenodon punctatus), en primitiv reptil, historiskt bebos de två största öarna i Nya Zeeland och minst 40 av öarna (Daugherty et al. 1990). Tuataran utrotades på huvudöarna på artonhundratalet och på 10 offshoreöar under de senaste decennierna, och upplever befolkningsminskningar på många av de andra öarna som ett resultat av introducerade däggdjur, främst råttor. Viltlevande grisar i Galapagosöarna, som först noterades av Darwin 1835, är bara en av de icke-inhemska arterna som har orsakat den nära utrotningen av Galapagos sköldpaddan (Geochelone elephantopus; Thornton 1971). Introducerade råttor misstänks ha förstört både ägg och unga sköldpaddor, men den första orsaken till nedgången var 1700-tals mariners som stannade vid öarna och lagrade sina fartyg med levande sköldpaddor som mat för sjömännen (Pritchard 1967).
Även införandet av icke-inhemska reptiler kan störa inhemska reptilsamhällen. Till exempel, Losos et al. (1993) visade att invasionen av Grand Cayman av exotiska brun anoles (Anolis sagrei) orsakat beteendeförändringar och förändringar i livsmiljön användning av inhemska arter, Anolis conspersus. På samma sätt har införandet av den bruna trädormen (Boiga irregularis) varit inblandad i extirpationen av gecko (Nactus pelagicus) från öarna Guam och Tinian; den bruna trädormen anses också ansvarig för dramatiska nedgångar i andra arter av inhemska ödlor på 13 av Marianerna (Rodda 1992).
Även om ön faunas är mest mottagliga för störningar, är de skadliga effekterna av invasiva på inhemska reptiler inte begränsade till öar. I kontinentala USA, importerade brand myror (Solenopsis invicta), infördes i Mobile, Alabama, så tidigt som 1918 (Wilson 1950), har rapporterats byte på både ägg (Moulis 1997) och young (Allen et al. 1997) av reptiler. Brandmyror är inblandade som en primär orsak till utrotning av Texas horned lizard (Phrynosoma cornutum) från en del av sitt geografiska område (Goin 1992).
Invasiva arter behöver inte vara andra djur. Både ökensköldpaddan (Gopherus agassizii) och gophersköldpaddan hotas av införandet av icke-inhemska växtarter (Stewart et al. 1993, Lovich 1995) som förändrar habitat struktur, native växt gemenskap sammansättning, och även brand frekvens. Den svarta benlösa ödla (Anniella pulchra nigra) ansågs för federal hotade status, delvis på grund av de negativa effekterna av icke-infödda Hottentot fig växter på ödlor’ offer basen i störda sand-dynerna habitat (Rutherford och Rorabaugh 1995); ett officiellt beslut fattades dock att inte räkna upp arten efter att livskraftiga ödlepopulationer hittades i ostört livsmiljö med inhemsk vegetation (Morey 1998). I Idaho, reptil artrikedom minskade med i genomsnitt 5% från 1978 till 1998 på 24 prov platser i Snake River rovfåglar Område (John Cossel Jr och Charles R. Peterson, Idaho State University, Pocatello ID, personlig kommunikation).